Родился 10 августа 1957 года в д. Богдановка Северного района Оренбургской области.
Окончил Бугурусланский нефтяной техникум. В 1981 году окончил Уфимский нефтяной институт. Доктор технических наук.
С 1981 года работал на нефтепромыслах Сахалина.
С 1985 по 1988 год - инструктором отдела промышленности Сахалинского обкома КПСС.
С 1989 года — начальник нефтегазодобывающего управления "Оханефтегаз", с октября 1994 года — генеральный директор ОАО "Роснефть-Сахалинморнефтегаз".
С октября 1998 года - президент ОАО "Роснефть". Председатель Советов директоров ОАО "Роснефть-Сахалинморнефтегаз" и "Роснефть-Пурнефтегаз".
С 2000 года — член правления Российского союза промышленников и предпринимателей (работодателей) (РСПП).
С 2001 года — член Совета директоров "Всероссийского банка развития регионов".
В марте 2003 года во время поездки на конференцию в Великобританию был подвергнут тщательному таможенному контролю. При этом сотрудниками спецслужб были скопированы частные и корпоративные документы, находившиеся у Богданчикова. В знак протеста Богданчиков немедленно возвратился в Россию.
Награжден орденом "Знак Почета". Заслуженный работник нефтяной и газовой промышленности РФ.
Член Попечительского совета Большого театра.
Женат. Имеет двоих сыновей.